党委（校长）办公室

纪委办公室

组织部（党校、人才办）

宣传部

统战部

党委巡察办公室

发展规划处（学科办）

机关党委

人事处（教师工作部）

学生处（学生工作部）

研究生院（研究生工作部）

国际合作与交流处（国际教学部）

财务处

国资处

后勤管理处

保卫处（保卫部、武装部）

医院管理处（医院工作部）

离退休处

关工委

工会

团委

社会合作处（校友会办公室）

基础医国产精品搬运

公共基础国产精品搬运

马克思主义国产精品搬运

临床医国产精品搬运

检验医国产精品搬运

护理国产精品搬运

医学影像国产精品搬运

药国产精品搬运

公共卫生国产精品搬运

生命科学国产精品搬运

精神卫生国产精品搬运

卫生管理国产精品搬运

口腔医国产精品搬运

全科医学系

体育艺术部

继续教育国产精品搬运（老年日本三级黄色片）

图书馆

网络信息中心

档案馆（校史馆）

校医院

安徽省全科医学发展研究中心

第一附属医院(第一临床国产精品搬运)

第二附属医院(第二临床国产精品搬运)

直属淮北人民医院